แบบจำลองอะตอมมีความจำเป็นเพราะอะตอมมีขนาดเล็กเกินไปที่เราจะเห็น
ดังนั้นเราทำการทดลอง จากผลลัพธ์เราคาดเดาว่าอะตอมมีลักษณะอย่างไร
จากนั้นเราทำการทดลองเพิ่มเติมเพื่อทดสอบการคาดเดานั้น จากผลลัพธ์เหล่านั้นเราปรับเปลี่ยนการคาดเดาของเราและกระบวนการจะดำเนินต่อไป
แบบจำลองนี้ช่วยให้เราสามารถคาดการณ์เกี่ยวกับพันธะเคมี, รูปทรงโมเลกุล, ปฏิกิริยาและอื่น ๆ
การคาดการณ์อาจไม่แม่นยำเสมอไป จากนั้นเราต้องทำการทดลองเพิ่มเติมเพื่ออธิบายผลลัพธ์
ห้าสิบปีต่อจากนี้จะมีการค้นพบใหม่เกี่ยวกับอะตอม แบบจำลองอะตอมในอนาคตอาจจะค่อนข้างแตกต่างจากที่เรารู้ตอนนี้