มนุษย์เปลี่ยนระบบนิเวศในหลาย ๆ ด้านเช่นการทำลายถิ่นที่อยู่มลภาวะการแนะนำสายพันธุ์ที่รุกรานและการใช้ประโยชน์จากสายพันธุ์มากเกินไป
วิธีที่พบมากที่สุดที่มนุษย์สร้างความเสียหายต่อระบบนิเวศคือการทำลายที่อยู่อาศัย ตัวอย่างเช่นเราลบต้นไม้เปลี่ยนการไหลของน้ำและเปลี่ยนทุ่งหญ้าเป็นฟาร์ม การปฏิบัติเหล่านี้สามารถนำไปสู่การสูญพันธุ์ของสายพันธุ์ท้องถิ่นและทำให้สายพันธุ์อื่นอพยพไปยังพื้นที่ใหม่
นอกจากนี้เรายังสร้างมลพิษทางอากาศและน้ำซึ่งนำไปสู่ผลกระทบมากมายต่อระบบนิเวศ ผลกระทบที่สำคัญอย่างหนึ่งของมลพิษทางอากาศคือการสะสมของก๊าซเรือนกระจกในชั้นบรรยากาศ ก๊าซเหล่านี้ดักจับความร้อนในชั้นบรรยากาศโลกทำให้โลกร้อนขึ้นและก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศโลก
การแนะนำสายพันธุ์ในระบบนิเวศใหม่อาจมีผลกระทบร้ายแรง ตัวอย่างเช่นหอยชนิดที่รุกรานกำลังเปลี่ยนแปลงอ่าวซานฟรานซิสโกอย่างมากเมื่อเทียบกับประชากรท้องถิ่นและเพลิดเพลินกับการระเบิดของประชากรโดยไม่ต้องล่า
การใช้ประโยชน์มากเกินไปลดขนาดของประชากรที่มีผลต่อการโต้ตอบภายในระบบนิเวศ มนุษย์ใช้ประโยชน์จากสิ่งมีชีวิตมากเกินไปโดย overhunting, overfishing, การตัดไม้อย่างไม่ยั่งยืนและการค้าสัตว์เลี้ยงที่ไม่มีการควบคุม (ดูภาพด้านล่าง)
